Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc94Q9D6J3 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms