Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tubgcp4Q9D4F8 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tubgcp4Q9D4F8 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tubgcp4Q9D4F8 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms