Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Trappc6bQ9D289 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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