Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2cQ9D1C1 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms