Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Susd3Q9D176 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Susd3Q9D176 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Susd3Q9D176 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Susd3Q9D176 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Susd3Q9D176 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Susd3Q9D176 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Susd3Q9D176 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms