Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F1

Ndc80, Kinetochore protein NDC80 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndc80Q9D0F1 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ndc80Q9D0F1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ndc80Q9D0F1 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ndc80Q9D0F1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ndc80Q9D0F1 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ndc80Q9D0F1 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ndc80Q9D0F1 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ndc80Q9D0F1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ndc80Q9D0F1 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ndc80Q9D0F1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ndc80Q9D0F1 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ndc80Q9D0F1 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ndc80Q9D0F1 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ndc80Q9D0F1 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ndc80Q9D0F1 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndc80Q9D0F1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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