Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms