Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms