Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd4Q9CWX4 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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