Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms