Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms