Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nicn1Q9CQM0 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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