Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms