Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Use1Q9CQ56 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Use1Q9CQ56 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Use1Q9CQ56 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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