Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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