Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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TrabdQ99JY4 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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TrabdQ99JY4 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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TrabdQ99JY4 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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TrabdQ99JY4 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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TrabdQ99JY4 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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TrabdQ99JY4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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TrabdQ99JY4 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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