Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms