Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PdgfdQ925I7 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PdgfdQ925I7 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PdgfdQ925I7 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PdgfdQ925I7 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PdgfdQ925I7 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PdgfdQ925I7 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PdgfdQ925I7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PdgfdQ925I7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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PdgfdQ925I7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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PdgfdQ925I7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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