Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trim59Q922Y2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim59Q922Y2 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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