Protein–RNA interactions for Protein: Q922L6

Nelfcd, Negative elongation factor D, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfcdQ922L6 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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NelfcdQ922L6 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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NelfcdQ922L6 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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NelfcdQ922L6 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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NelfcdQ922L6 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
NelfcdQ922L6 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms