Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Smg8Q8VE18 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
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Smg8Q8VE18 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Smg8Q8VE18 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Smg8Q8VE18 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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