Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vrk3Q8K3G5 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vrk3Q8K3G5 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vrk3Q8K3G5 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vrk3Q8K3G5 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Vrk3Q8K3G5 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Vrk3Q8K3G5 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Vrk3Q8K3G5 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vrk3Q8K3G5 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
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