Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Nek9Q8K1R7 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek9Q8K1R7 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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Nek9Q8K1R7 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Nek9Q8K1R7 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Nek9Q8K1R7 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Nek9Q8K1R7 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Nek9Q8K1R7 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Nek9Q8K1R7 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Nek9Q8K1R7 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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