Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Afg3l2Q8JZQ2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Afg3l2Q8JZQ2 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Afg3l2Q8JZQ2 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Afg3l2Q8JZQ2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Afg3l2Q8JZQ2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Afg3l2Q8JZQ2 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Afg3l2Q8JZQ2 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Afg3l2Q8JZQ2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Afg3l2Q8JZQ2 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Afg3l2Q8JZQ2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Afg3l2Q8JZQ2 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms