Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms