Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

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Length 628 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Nek11Q8C0Q4 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Nek11Q8C0Q4 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Nek11Q8C0Q4 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Nek11Q8C0Q4 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Nek11Q8C0Q4 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Nek11Q8C0Q4 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Nek11Q8C0Q4 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Nek11Q8C0Q4 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Nek11Q8C0Q4 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Nek11Q8C0Q4 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Nek11Q8C0Q4 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Nek11Q8C0Q4 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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