Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttc28Q80XJ3 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Ttc28Q80XJ3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Ttc28Q80XJ3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Ttc28Q80XJ3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Ttc28Q80XJ3 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Ttc28Q80XJ3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Ttc28Q80XJ3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Ttc28Q80XJ3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Ttc28Q80XJ3 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Ttc28Q80XJ3 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc28Q80XJ3 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms