Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Vmn1r76-201ENSMUST00000058772 975 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Olfr1124-201ENSMUST00000062494 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Olfr1474-201ENSMUST00000096202 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Gm43341-201ENSMUST00000200104 1308 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Pbdc1-202ENSMUST00000119477 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 A330102I10Rik-201ENSMUST00000130109 501 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Gm43491-201ENSMUST00000197133 784 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Gm45401-201ENSMUST00000209456 733 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms