Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC1

Prrc2a, Protein PRRC2A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2aQ7TSC1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms