Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LnpkQ7TQ95 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LnpkQ7TQ95 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms