Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtifQ6PEE2 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms