Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Krt77Q6IFZ6 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Krt77Q6IFZ6 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt77Q6IFZ6 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms