Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms