Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFZ1

Gbf1, Golgi-specific brefeldin A-resistance factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbf1Q6DFZ1 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gbf1Q6DFZ1 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gbf1Q6DFZ1 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gbf1Q6DFZ1 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gbf1Q6DFZ1 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gbf1Q6DFZ1 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gbf1Q6DFZ1 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gbf1Q6DFZ1 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gbf1Q6DFZ1 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gbf1Q6DFZ1 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gbf1Q6DFZ1 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gbf1Q6DFZ1 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gbf1Q6DFZ1 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gbf1Q6DFZ1 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gbf1Q6DFZ1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gbf1Q6DFZ1 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gbf1Q6DFZ1 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gbf1Q6DFZ1 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gbf1Q6DFZ1 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gbf1Q6DFZ1 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gbf1Q6DFZ1 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gbf1Q6DFZ1 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gbf1Q6DFZ1 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gbf1Q6DFZ1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gbf1Q6DFZ1 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gbf1Q6DFZ1 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gbf1Q6DFZ1 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gbf1Q6DFZ1 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gbf1Q6DFZ1 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gbf1Q6DFZ1 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gbf1Q6DFZ1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gbf1Q6DFZ1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Gbf1Q6DFZ1 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gbf1Q6DFZ1 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gbf1Q6DFZ1 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gbf1Q6DFZ1 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gbf1Q6DFZ1 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gbf1Q6DFZ1 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gbf1Q6DFZ1 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gbf1Q6DFZ1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gbf1Q6DFZ1 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gbf1Q6DFZ1 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
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Gbf1Q6DFZ1 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gbf1Q6DFZ1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Gbf1Q6DFZ1 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Gbf1Q6DFZ1 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Gbf1Q6DFZ1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms