Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Pdzrn3Q69ZS0 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
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Pdzrn3Q69ZS0 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Pdzrn3Q69ZS0 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Pdzrn3Q69ZS0 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Pdzrn3Q69ZS0 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Pdzrn3Q69ZS0 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Pdzrn3Q69ZS0 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Pdzrn3Q69ZS0 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Pdzrn3Q69ZS0 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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