Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sall3Q62255 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sall3Q62255 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms