Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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AtrxQ61687 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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