Protein–RNA interactions for Protein: Q61660

Foxj1, Forkhead box protein J1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxj1Q61660 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Foxj1Q61660 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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