Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Usf1Q61069 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Usf1Q61069 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Usf1Q61069 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Usf1Q61069 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Usf1Q61069 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usf1Q61069 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms