Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
JrkQ60976 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
JrkQ60976 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
JrkQ60976 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms