Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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CttnQ60598 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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CttnQ60598 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CttnQ60598 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CttnQ60598 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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