Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Tsr1Q5SWD9 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Tsr1Q5SWD9 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Tsr1Q5SWD9 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Tsr1Q5SWD9 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Tsr1Q5SWD9 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Tsr1Q5SWD9 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm18829-201ENSMUST00000188150 1622 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tsr1Q5SWD9 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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