Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

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Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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