Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms