Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
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Gm648Q3UJ22 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Gm648Q3UJ22 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
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Gm648Q3UJ22 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Gm648Q3UJ22 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Gm648Q3UJ22 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Gm648Q3UJ22 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Gm648Q3UJ22 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm648Q3UJ22 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms