Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20281-201ENSMUST00000188225 267 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 AC159293.2-201ENSMUST00000222289 424 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Klri1-201ENSMUST00000088046 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 5830473C10Rik-202ENSMUST00000200765 1691 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42905-201ENSMUST00000196237 1611 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7344-201ENSMUST00000212122 1222 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44090-201ENSMUST00000204669 1834 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms