Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rnf40Q3U319 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rnf40Q3U319 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rnf40Q3U319 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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Rnf40Q3U319 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Rnf40Q3U319 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf40Q3U319 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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