Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
XylbQ3TNA1 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
XylbQ3TNA1 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
XylbQ3TNA1 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
XylbQ3TNA1 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms