Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms