Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Hdgfl1Q2VPR5 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Hdgfl1Q2VPR5 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Hdgfl1Q2VPR5 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Hdgfl1Q2VPR5 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Hdgfl1Q2VPR5 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Hdgfl1Q2VPR5 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Hdgfl1Q2VPR5 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Hdgfl1Q2VPR5 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Hdgfl1Q2VPR5 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Hdgfl1Q2VPR5 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Hdgfl1Q2VPR5 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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